Фамилия Шихорина — женская форма фамилии Шихорин, и её разбор стоит начать с мужского варианта. В основе лежит прозвище или мирское имя Шихоря. Это слово, скорее всего, связано с диалектным глаголом «шихорить» — так в некоторых говорах, особенно на севере и Урале, называли шарить, рыться, искать что-то украдкой или делать что-то небрежно, кое-как. Отсюда Шихорей могли прозвать суетливого, неаккуратного человека или того, кто любит копаться в чужих вещах. Прозвища на -оря (ср. Мямля, Гуля, Коря) в русском языке часто давались по характерной черте поведения.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность. Шихорин — «сын Шихори» или «человек из семьи Шихори». Такие фамилии типичны для северорусских и центральных регионов, где отчества и прозвищные фамилии на -ин широко распространены. Если бы основа оканчивалась на твёрдый согласный, был бы суффикс -ов, но здесь мягкий «р» даёт именно -ин.

Существует и менее вероятная, но возможная версия: Шихоря могло быть искажением тюркского имени или прозвища. В тюркских языках есть корень «ших» (от арабского «шейх») — старейшина, почтенный человек. Однако в русском быту такое имя почти не фиксируется, а переход «ших» в «шихор» маловероятен без дополнительного суффикса. Поэтому бытовая, русская версия с глаголом «шихорить» выглядит убедительнее.

Фамилия редкая. По данным переписей и телефонных справочников, Шихорины встречаются в основном в Пермском крае, Кировской области и на Урале — то есть именно там, где диалектное слово «шихорить» было в ходу. Это косвенно подтверждает прозвищное происхождение: фамилия «привязана» к местному говору, а не к книжному или церковному имени.

Женская форма Шихорина не меняет смысла, а лишь указывает на пол носителя. В современном русском языке такие фамилии склоняются как обычные прилагательные: Шихориной, Шихорину. Если искать однокоренные фамилии, то стоит обратить внимание на Шихов, Шихарев, Шихалёв — но у них, скорее всего, другая основа (от «шихан» — холм или от имени Ших). Шихорина стоит особняком, и её корень — именно в поведенческом прозвище.