Фамилия Шикмакова — женская форма фамилии Шикмаков. В русской традиции такие фамилии образуются добавлением суффикса -а к мужскому варианту, и это не меняет их происхождения. Мужская форма стоит в именительном падеже, женская — в родительном, что исторически связано с обозначением «жена Шикмакова» или «дочь Шикмакова».

Основа фамилии — прозвище или неканоническое имя Шикмак. Словообразовательная модель простая: корень Шикм- плюс суффикс -ак, типичный для русских прозвищ (ср. Бурлак, Рыбак, Простак). Фамильный суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Шикмаков.

Корень Шикм- — самый спорный элемент. Вероятнее всего, он восходит к тюркскому корню, так как -мак — распространённый тюркский суффикс инфинитива, а слово шик в тюркских языках означает «удар», «толчок» или «крик». В таком случае Шикмак могло быть прозвищем драчливого, крикливого или резкого человека. Менее вероятна, но возможна связь с диалектным русским словом «шикать» (шипеть, кричать «шиш»), тогда прозвище означало бы того, кто шикает или ведёт себя заносчиво.

География фамилии неширокая. Шикмаковы встречаются преимущественно в Поволжье и на Урале — регионах, где веками соседствовали русские и тюркские народы. Это косвенно подтверждает тюркскую версию корня. В списках дворянских родов фамилия не значится, а значит, предки носителя, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. В документах XVIII–XIX веков фамилия могла писаться через «а» — Шикмаковъ, что не меняет сути.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Шикманов, Шикматов) показывает, что Шикмакова стоит особняком: суффикс -ак в основе встречается реже, чем -ан или -ат, что делает фамилию более редкой и локальной.