Фамилия Шикшните — одна из тех, что сразу выдают литовское происхождение носителя. Её выдают окончание и суффикс: -ите (-ytė) в литовском языке — типичный матримониальный суффикс, обозначающий незамужнюю женщину или дочь. То есть Шикшните — это форма женской фамилии, образованная от мужской основы Шикшнис (Šikšnis) или Шикшна (Šikšna). Если бы речь шла о мужчине, фамилия звучала бы как Шикшнис, а для замужней женщины — Шикшнене.

Корень фамилии — литовское слово šikšna, что означает «кожа», «шкура» или «сыромятная кожа». В переносном смысле так могли прозвать человека с грубой, жесткой кожей, либо того, кто работал с кожей: кожевника, скорняка, шорника. В литовской ономастике фамилии, образованные от названий ремесел и материалов, встречаются часто, и Шикшните — не исключение. Прозвище Шикшна мог закрепиться за мастером, выделывавшим кожи, или за человеком, которого в деревне называли «кожаным» за черты характера или внешность.

С точки зрения географии, фамилия Шикшните и её мужские варианты наиболее распространены в Литве, особенно в северных и центральных регионах (Жемайтия, Аукштайтия). В России и других странах бывшего СССР она встречается редко, преимущественно среди потомков литовцев, переселившихся в советское время, или в смешанных семьях, где сохранена женская форма фамилии.

Важно помнить: в русском языке фамилия Шикшните, как и другие литовские фамилии на -те, -це, -не, не склоняется по падежам. Это грамматическая особенность, которая часто сбивает с толку при заполнении документов. Сама по себе фамилия не указывает на дворянское или крестьянское происхождение — в Литве такие фамилии носили в основном крестьяне и ремесленники, так как литовская знать (шляхта) чаще использовала фамилии на -ский/-цкий.