Фамилия Шикшин — один из тех случаев, когда корень слова не бросается в глаза, а суффикс подсказывает географию. Давайте разбираться по порядку.

Первое, что видит глаз, — суффикс -ин. В русской фамильной модели он указывает на принадлежность: «чей?» — «Шикшин», то есть сын или потомок человека по имени или прозвищу Шикша. Такая модель типична для северных и центральных регионов России, где -ин конкурировал с -ов, но чаще закреплялся за основами, оканчивающимися на -а или -я. Однако основа «Шикш» — не женское имя, а скорее прозвище или этноним.

Корень «шикш» вызывает ассоциации с тюркскими языками. В ряде тюркских наречий «шикш» или близкие формы означают «острый», «колючий» или даже «шип». Это могло быть прозвищем человека с острым языком, колючим характером или внешней особенностью (например, торчащие волосы). Но есть и более конкретная версия: в некоторых диалектах татарского и башкирского языков «шикш» — это название птицы, возможно, чечевицы или щегла. Прозвища по птицам были распространены у тюркских народов: давали за яркое оперение, звонкий голос или манеру поведения.

Ещё один возможный след — топонимический. В Башкортостане и Татарстане встречаются деревни с названием Шикша или Шикш. Житель такой деревни мог получить фамилию по месту выхода: Шикшин — «выходец из Шикши». Это типичная модель для русских фамилий, образованных от названий поселений, особенно в зоне межэтнического контакта.

Менее вероятная, но существующая версия — связь с коми-зырянским словом «шикш» (мелкий лес, чаща). Если предки жили на Урале или в Пермском крае, прозвище могло относиться к человеку, жившему в глухом лесу или занимавшемуся лесным промыслом. Однако эта гипотеза слабее, так как фамилия Шикшин практически не встречается в коми-пермяцких регионах, зато фиксируется в Поволжье и на Южном Урале.

Таким образом, наиболее правдоподобно, что Шикшин — фамилия тюркского происхождения, образованная от прозвища Шикша (острый, колючий, либо птица) с русским патронимическим суффиксом -ин. Предки носителя фамилии, скорее всего, жили в зоне русско-тюркского пограничья — в Поволжье, Приуралье или на Южном Урале, и могли быть как крестьянами, так и служилыми людьми, принявшими православие и русскую фамилию. Сословная принадлежность без конкретных записей не определяется, но география указывает на среду, где фамилии часто давали по прозвищам, а не по роду занятий.