Фамилия Шилинцев происходит от древнейшей формы славянских фамильных прозвищ, образованных от географического названия местности, выходцем из которой являлся один из предков. Фамилия Шилинцев восходит к топониму Шилино или Шилинка. Населенные пункты с такими названиями широко распространены на территории России. Так, известны: деревня Шилинка в Брянской области, село Шилинка в Красноярском крае, деревня Шилино в Смоленской области. Сами топонимы, предположительно, происходят от литовского прилагательного silinis – «боровой, вересковый». Вероятно, основатель фамилии Шилинцевых был выходцем из населенного пункта под названием Шилино или Шилинка. В результате, потомок человека, обладающего прозвищем Шилинец, со временем получил фамилию Шилинцев. О точном месте и времени возникновения фамилии Шилинцев в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Шилинцев представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.