Фамилия Шилонцев относится к распространенному типу еврейских фамилий. Фамилия Шилонцев образована от прозвища Шилонец, которое, вероятно, восходит к названию древнейшего библейского города Шилон (Силом) от которого сейчас остались едва заметные развалины под названием Сейлун. Само название города Шилон происходит от еврейского слова «шило», что в переводе на русский язык означает «примиритель». Также существует имя Шилон, которое, вероятно, ведет свое начало от названия этого города. Фамилия Шилонцев представляет собой отчество второго порядка: Шилонцев — сын Шилонца и внук Шилона. Например, только у евреев можно было встретить такие фамилии, как Вейценбаум, что в переводе с немецкого означало «пшеничное дерево», Зауэрштром – «кислый поток», Левенфиш – «рыба-лев», Цигенбаум – «козье дерево», Квечман – «высказываться неохотно». Все это свидетельствует о том, что фамилия Шилонцев представляет собой замечательный памятник европейской письменности и культуры. Однако процесс формирования фамилий был достаточно длительным, поэтому окончательно говорить о точном месте и времени возникновения фамилии Шилонцев можно лишь на основании генеалогических исследований.