Фамилия Шинтукова — женская форма фамилии Шинтуков, и её происхождение уходит корнями в языки Северного Кавказа. Основная версия связывает её с адыгскими (черкесскими) языками, где основа «шинту» могла означать либо прозвище, либо название местности. В адыгском языке «шын» (психологическое состояние) или «шынэ» (страх, робость), а «тIу» — два. Вместе слово могло дать прозвище «дважды робкий» или «двойной страх», но это скорее народная этимология. Более правдоподобно, что «Шинтук» — это адыгская фамилия, образованная по модели «-ку» (сын, потомок), то есть «потомок Шинта» или «сын Шинта». Само имя Шинт могло быть вариантом имени Шинтимир (распространённого у адыгов) или происходить от тюркского «шын» (истина, правда), что дало бы значение «истинный человек».

Суффикс -ов в фамилии Шинтуков — типичный для русской адаптации кавказских фамилий. Когда в XIX веке черкесские фамилии фиксировали в документах Российской империи, к основе добавляли русское окончание, чтобы вписать в систему родственных связей. Поэтому Шинтуков буквально означает «принадлежащий к роду Шинтуковых». Географически фамилия тяготеет к Кабардино-Балкарии и Карачаево-Черкесии, где адыгский этнос составляет значительную часть населения. Встречается она и у осетин (дигорская ветвь), что объясняется давними контактами народов.

Редкость фамилии в том, что она почти не имеет однокоренных вариантов за пределами Кавказа. В отличие от распространённых Шинкарёвых или Шиндяпиных, Шинтукова сохраняет кавказскую основу почти без изменений. Предки носительницы этой фамилии, скорее всего, были адыгскими узденями (дворянами) или свободными крестьянами, жившими в горных аулах. Никаких документальных подтверждений о знатности рода нет, но в адыгском обществе фамилии с суффиксом -ку обычно указывали на древность рода.