Фамилия Шипилина образована от прозвища Шипиля. С одной стороны, в старину Шипилей называли человека с нечеткой речью, шипящим произношением, или тихим голосом. Однако это прозвище могло пристать и к человеку язвительному (от нарицательного «шип» – «колючка»). Известный обладатель фамилии _ Шипилин Анатолий Вениаминович, кандидат физико-математических наук, старший научный сотрудник Вычислительного центра им. Дородницына Российской Академии Наук, доцент Московского физико-технического института. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шипиля, со временем получил фамилию Шипилина.