Фамилия Шишлаков образована от прозвища Шишлак. Возможно, прозвище Шишлак восходит к татарскому глаголу «шишлять» - «копаться, мешкать». Соответственно, его мог получить медлительный человек. Согласно другой версии, в основе этой фамилии лежит слово «шишлик» («шашлык»). Оно образовано от слова şiş – «вертел» и буквально означает «нечто, приготовленное на вертеле». Таким образом, прозвище Шишлак мог получить и шашлычник, тогда оно относится к так называемым «профессиональным» именованиям, указывающим на род деятельности человека. Чередование гласных и/а стало результатом исторических процессов, происходивших в ходе развития языка. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шишлак, со временем получил фамилию Шишлаков.