Фамилия Шиштанов — редкий пример, где прозвище, лёгшее в основу, почти не оставило следов в письменных источниках, но хорошо восстанавливается через живые говоры. Основа здесь — «шиштан». В диалектах русского языка, особенно в южных и центральных областях, «шиштан» или «шишта́н» — это не только «шиш» (острый предмет, шип), но и человек с характером: задиристый, колкий, «шишковатый», то есть неуживчивый, либо, наоборот, пройдоха и хитрец. В некоторых говорах так называли того, кто вечно встревает в споры, «шишом» торчит.

Фамилия образована по стандартной патронимической модели: суффикс -ов указывает на принадлежность — «сын Шиштана». То есть предок носителя фамилии носил прозвище Шиштан. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: Шишта́нов, хотя в бытовой речи возможны колебания. Суффикс -ан в русских прозвищах часто придавал оттенок просторечия или пренебрежения (ср. «толстан», «горлан»), поэтому прозвище Шиштан могло звучать неодобрительно, но не грубо.

Географически фамилия тяготеет к центрально-чернозёмным областям России и Поволжью. Встречается в Тамбовской, Рязанской, Нижегородской губерниях — там, где слово «шиштан» было в ходу. За пределами России фамилия редка, что подтверждает её сугубо местное, диалектное происхождение. Никакой связи с тюркскими языками или этнонимами здесь нет, несмотря на созвучие с некоторыми восточными корнями.

Интересная деталь: в старых переписях фамилия иногда писалась через «е» — «Шештанов». Это не ошибка, а отражение акающего произношения (шиштан → шештан), характерного для тех же южнорусских земель. Поэтому, встречая вариант написания «Шештанов», можно с высокой вероятностью говорить о том же корне. В целом, Шиштанов — фамилия, которая прямо указывает на характер или манеру поведения предка: колкого, бойкого, возможно, неспокойного человека, которого в деревне запомнили по меткому прозвищу.