Фамилия Шкафронов — одна из тех, где внешняя понятность обманчива. Кажется, что в её основе лежит слово «шкаф», но на деле всё сложнее и интереснее. Прямая связь с мебелью маловероятна: прозвище Шкаф или Шкафрон могли дать человеку крупного, плотного телосложения («шкафообразному»), но это лишь бытовая догадка. Лингвистический разбор указывает на другой корень.

Ключ к разгадке — суффикс «-онов», который характерен для фамилий, образованных от имён или прозвищ, оканчивающихся на «-он». Основа «Шкафр-» встречается крайне редко. Скорее всего, это искажённая или диалектная форма греческого имени Скафр (Σκαφρός) или его производных. В греческой ономастике имя Скафрос означало «землекоп», «копатель», но могло относиться и к человеку, который делал лодки-долблёнки (от «скафос» — лодка, корыто). Через украинское или южнорусское посредничество «С» могло перейти в «Ш», а «-ос» — в привычное русское окончание «-он». Таким образом, Шкафронов — это «внук Скафроса», то есть потомок человека, который либо копал землю (например, могильщик или рудокоп), либо выдалбливал лодки.

Вторая версия, менее вероятная, но имеющая право на существование, — связь с тюркским словом «шкаф» в значении «сундук» или «ларь». В этом случае прозвище Шкафрон мог получить сундучный мастер или торговец, но такая модель словообразования для тюркских заимствований в русских фамилиях нетипична: обычно они дают основы без наращения «-р-».

Фамилия редкая и, по косвенным данным, тяготеет к югу России и Украине, где греческое влияние было сильнее. Никаких дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это однозначно крестьянская или мещанская фамилия, возникшая не раньше XVII века, когда в обиход вошли фамилии на «-ов». Носители фамилии Шкафронов, скорее всего, происходят из среды ремесленников или сельских работников, чей род занятий был связан с землёй или деревом.