Фамилия Шкамета — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, это пример фамилии, образованной от прозвища, которое дали человеку по характерной черте или роду занятий. Основа «шкамет» или «шкамета» не встречается в распространённых славянских именах или названиях профессий, поэтому стоит искать в диалектах или в иноязычных корнях.

Одна из самых правдоподобных версий связывает фамилию с украинским или южнорусским диалектным словом «шкамета» — так в некоторых регионах называли кусок, осколок, щепку, лоскут или обрывок ткани. Прозвище Шкамета мог получить либо человек, занимавшийся мелкой торговлей тканью или лоскутами, либо тот, кто ходил в рваной, словно «лоскутной», одежде. В переносном смысле могли назвать и невысокого, щуплого человека — как «осколок» от большого. Суффикс -а в конце указывает на то, что прозвище было оформлено по образцу существительных общего рода (как «бедняга», «растяпа»), что типично для украинской и белорусской ономастики.

Менее вероятная, но возможная гипотеза — связь с польским или западноукраинским словом «szkamat» (от немецкого «Schamott» — шамот, огнеупорная глина). В таком случае прозвище могли дать гончару или печнику, работавшему с огнеупорными материалами. Однако эта версия слабее, так как фамилия не зафиксирована в западных регионах с высокой плотностью.

Географически фамилия Шкамета встречается в основном в центральной и восточной Украине, а также среди потомков переселенцев на Кубани и в Ставрополье. Это позволяет предполагать, что её носители — выходцы из казачьих или крестьянских слоёв, где прозвища были особенно живучими. Модель образования без патронимического суффикса (-ов, -ин) — чисто украинская, когда прозвище переходило в фамилию в неизменной форме.

Сравнение с однокоренными фамилиями вроде Шкамата, Шкаматов, Шкаметенко подтверждает, что корень «шкамет» существовал в прозвищной среде, но не был широко распространён. Так что носитель фамилии Шкамета — почти наверняка потомок человека, которого в своём кругу выделяли либо по отношению к тряпью и лоскутам, либо по внешней мелкой стати.