Фамилия Шкепу — наглядный пример того, как в русской ономастике закрепилась фамилия, не имеющая славянских корней. Её основа восходит к молдавскому или румынскому слову «șchep» — «заноза», «щепка», «осколок». В переносном смысле так могли прозвать либо очень худого, «щепетильного» человека, либо того, кто донимал окружающих придирками — «занозистого» по характеру. Это прозвище, скорее всего, закрепилось за выходцем из Бессарабии или Молдавии, а затем было русифицировано.

Ключевая особенность фамилии Шкепу — её «застывшая» форма. В отличие от подавляющего большинства русских фамилий, она не имеет типичных суффиксов принадлежности (-ов, -ев, -ин). Перед нами чистое прозвище в именительном падеже, которое не склонялось и не переделывалось по русской модели. Такое явление характерно для поздних переселенцев или для фамилий, возникших на юго-западных окраинах Российской империи, где смешивались языки и традиции имянаречения.

Встречается и альтернативная, менее распространённая версия: связь с диалектным украинским или польским словом «шкепа» (кляча, плохая лошадь). В этом случае фамилия могла указывать на занятие человека — извозчика или конюха, работавшего с изнурёнными животными. Однако молдавская этимология выглядит более убедительной, учитывая географию бытования фамилии: её носители чаще всего встречаются в Одесской области, Приднестровье и среди потомков бессарабских переселенцев.

С точки зрения словообразования, Шкепу — редкая для русского уха «окаменевшая» основа. Она не дала вариаций с суффиксами (нет Шкеповых или Шкепиных в классическом понимании), а значит, фамилия относительно молодая и не успела пройти долгий путь адаптации в официальных документах. По сути, это прямое свидетельство того, что предок носителя получил фамилию не от отца по имени, а от собственного уличного прозвища, которое и записали в метрику без изменений.