Фамилия Шкльниковы — редкий случай, когда написание подсказывает разгадку быстрее, чем произношение. В ней нет буквы «о» после «ш», и это не опечатка, а ключ к происхождению. Если бы фамилия звучала как «Школьников», её основа была бы прозрачна: от слова «школа», то есть предок либо учительствовал, либо служил при школе. Но «Шкльниковы» указывает на иную, более древнюю фонетику.

Корень здесь — древнерусское «шклъ» или «школъ», что означало не учебное заведение, а изделие из кожи, чаще всего кошель или мешок. В говорах «шкля» — это кожаный мешочек для денег, а «шкльник» — тот, кто их шил или торговал ими. Таким образом, Шкльниковы — потомки ремесленников-кожевников или мелких торговцев, носивших при себе кошель как профессиональную примету. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Шкльника».

Модель образования типична для прозвищ по роду занятий: мастеровой человек получал имя по изделию, а его дети наследовали фамилию. В отличие от фамилии Школьников (от школы), Шкльниковы не связаны с образованием. Это редкое явление, когда орфография сохранила редуцированный гласный, исчезнувший в литературном языке. В документах XVII–XVIII веков встречаются варианты «Шклеников» и «Шкляников» — все они ведут к одному источнику: кожаному кошелю.

Географически фамилия тяготеет к северо-западу России и Белоруссии, где ремесло кожевников было развито особенно сильно. В переписных книгах Псковской и Смоленской губерний изредка встречаются Шкльниковы — чаще всего среди посадских людей и ремесленников. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано, что подтверждает её «низовое» происхождение.

Ошибочно связывать фамилию с диалектным «шкляный» (стеклянный) — это случайное созвучие. Стекло в русских говорах называли «скло» или «стекло», а «шкло» — это польское влияние, но в фамилиях на -ников оно не дало устойчивой формы. Версия с кошелем подтверждается и тем, что в украинском языке «шкіра» — кожа, а «шкільник» — кожевник, что полностью совпадает со словообразовательной логикой.