Фамилия Шкурдин звучит как типичная русская фамилия, но при ближайшем рассмотрении её основа оказывается не такой однозначной. В отличие от большинства фамилий на -ин, которые образованы от имён или прозвищ, оканчивающихся на -а/-я (Иван → Иванов, но Кузьма → Кузьмин), здесь корень «шкурд-» — редкость. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — шкурдин, то есть сын или потомок человека по прозвищу Шкурда.

Основная версия происхождения прозвища — диалектное слово «шкурда». В южнорусских и украинских говорах так называли старую, потрёпанную шкуру, а в переносном смысле — неопрятного, обтрёпанного человека. В некоторых областях слово «шкурда» означало ещё и «хворостина», «прут» — тогда прозвище могло достаться человеку сухопарому или, наоборот, драчливому, озорному. Есть и более редкая версия: в псковских говорах «шкурда» — это сварливый, бранчливый человек. Все эти значения укладываются в модель прозвищ, которые давали по внешнему виду или характеру.

Менее вероятно, но возможно, что фамилия связана с профессией. Если допустить, что в основе лежит «шкура» и некий суффикс, то Шкурдин мог быть потомком кожевника или скорняка. Однако для профессии в русском языке были типичны другие суффиксы (Скорняков, Кожевников), а «шкурда» — это всё-таки народное, бытовое слово, а не ремесленный термин.

Географически фамилия тяготеет к югу России и востоку Украины. Встречается в Воронежской, Курской, Ростовской областях, а также в Белгородчине — как раз там, где слово «шкурда» было в ходу. В северных и центральных регионах России эта фамилия редка.

С точки зрения словообразования, Шкурдин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Шкурдов, Шкурко, Шкуратов. Все они восходят к корню «шкур-», но различаются суффиксами: -дин (редкий, почти уникальный вариант), -дов, -ко. Учитывая, что фамилий на -дин в русском языке немного (сравни: Жердин, Халдин), можно предположить, что прозвище Шкурда было локальным и не слишком распространённым — а значит, и носителей фамилии исторически было немного, и они могли быть потомками одной конкретной семьи из южнорусского села.