Фамилия Шкурыгина образовалась от прозвища Шкурыга. Оно, в свою очередь, восходит к нарицательному «шкура» со значением «сырая кожа». Скорее всего, это прозвище относилось к профессиональным именованиям, указывающим на род деятельности предка: очевидно, он был кожевенником или скорняком, то есть мастером по обработке шкур и изготовлению кожаных или меховых изделий. Согласно другой версии, прозвище Шкурыга связано с глаголом «шкурать», который в архангельских говорах означает «бросаться на жертву (о хищной птице)», в псковских - «ткнуть; понукать, хлестать, прогонять». В таком случае Шкурыгой могли называть сурового, строгого, хладнокровного человека. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шкурыга, со временем получил фамилию Шкурыгина.