Фамилия Шлепанова — женская форма, а мужская, Шлепанов, образована по стандартной для русских фамилий модели: от основы прозвища или профессии через суффикс -ов. Этот суффикс указывает на принадлежность («чей?»), то есть Шлепанов — сын или потомок человека по прозвищу Шлепан.

Самая прямая и очевидная версия происхождения — от глагола «шлёпать». В русских говорах это слово имело широкий спектр значений: не только «бить, хлопать», но и «ходить с шумом, тяжело ступать», «делать что-то небрежно», «лепить из глины». Прозвище Шлепан могли дать неуклюжему, медлительному человеку, либо тому, кто занимался грубой работой — например, валял валенки или месил глину. В некоторых регионах «шлёпанцами» называли домашние туфли, так что прозвище могло закрепиться за сапожником или тем, кто постоянно носил стоптанную обувь.

Менее вероятная, но не исключённая версия — связь с диалектным словом «шлепа» (или «шлёпа») в значении «губа», «обвислая губа» или «ротозей». В таком случае прозвище носило бы описательный характер внешности, что тоже типично для русских фамилий.

Фамилия редкая и не имеет широкой географической привязки, но её основа — чисто русская, без иноязычных корней. Встречается преимущественно в центральных и поволжских регионах. В отличие от фамилий с суффиксом -ин (от основ на -а/-я), здесь суффикс -ов, что указывает на основу мужского рода — Шлепан. В дореволюционных переписях носители, скорее всего, были крестьянами или мещанами, и фамилия закрепилась как отчество от прозвища, а не от канонического имени.