Фамилия Шлипаков — довольно редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В её основе лежит прозвище или профессия, но точное значение зависит от того, на какой диалект или язык опираться.

Самый прямой путь — от слова «шлипак». В южнорусских и украинских говорах так могли называть человека, который шьёт или носит шляпы, или же самого шляпника. Однако есть и вторая, более колоритная версия: «шлипак» — это разновидность широкополой шляпы, войлочной или соломенной. В таком случае прозвище могли дать тому, кто постоянно ходил в подобном головном уборе, либо ремесленнику, который их валял. Сравните с фамилиями Шляпников, Шаповалов — та же модель, но с другим корнем.

Суффикс -ов указывает на типичную русскую патронимическую форму: Шлипаков — буквально «сын Шлипака». Фамилия закрепилась в среде крестьян и мещан, где прозвища по одежде или занятию были обычным делом. Если копнуть глубже, «шлипать» в некоторых говорах означало «шлёпать», «бить», но это менее вероятная основа — тогда фамилия звучала бы как Шлёпаков, а не Шлипаков.

Встречается фамилия преимущественно на юге России и в восточных областях Украины. В дореволюционных записях носители Шлипаковы фиксировались в Курской, Воронежской губерниях и на Кубани. Известных исторических личностей с такой фамилией нет, что типично для прозвищных фамилий непривилегированных сословий.

Однокоренные варианты — Шлипак, Шлипаченко, Шлипаковский — встречаются реже и указывают на ту же основу, но с разными суффиксами, характерными для украинской или польской традиции.