Фамилия Шлипотеева — редкий случай, когда в основе лежит не имя, не профессия и не географическое название, а, скорее всего, прозвище, связанное с ремеслом или характерным действием. Разбираем слово по частям. Корень «шлипот-» явно восходит к глаголу «шлипать» или «шлёпать». В русских говорах «шлипотать» означало «шлёпать по грязи, месить грязь» или «ходить в мокрой обуви, издавая хлюпающие звуки». Человек, получивший такое прозвище, мог быть сапожником (чинил обувь, шлёпал молотком), либо просто неопрятным, медлительным пешеходом, который вечно ходит по лужам. Суффикс «-еев» (в женском варианте «-еева») указывает на принадлежность: Шлипотеев — сын или потомок Шлипотея. Модель образования типична для русских фамилий от прозвищ на мягкий согласный (ср. Коптеев от «коптить», Хлюптеев от «хлюпать»).

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и центральным областям, где диалектное слово «шлипотать» было в ходу. Встречается она крайне редко — в основном в Тамбовской, Рязанской и Воронежской губерниях. В дореволюционных метрических книгах и переписях XVIII–XIX веков носители фамилии числились преимущественно среди государственных крестьян и однодворцев. Однодворцы — особое сословие, потомки служилых людей, которые несли сторожевую службу на южных рубежах, но со временем обеднели и слились с крестьянством. Поэтому предки Шлипотеевых могли быть не просто землепашцами, а бывшими пограничниками или казаками, получившими прозвище за манеру ходить или за занятие.

В написании фамилии возможна путаница: иногда её записывали как Шлипатеева или Шлёпотеева, что связано с местным произношением — «аканьем» (говорят «шлипатать», а пишут «шлипотать»). Но корень остаётся тем же. Сравните с однокоренными, но более известными фамилиями: Шлёпкин, Шлёпников (от «шлёпать»), а также Шлипаков (от «шлипак» — вид обуви или тряпка). Шлипотеева стоит особняком из-за суффикса «-еев», который редко встречается в фамилиях от глагольных основ, что делает её ещё более своеобразной.

Если коротко: фамилия происходит от прозвища Шлипотей — человека, который «шлипотал», то есть шлёпал по грязи или стучал сапожным молотком. Носители — в основном потомки крестьян и однодворцев из южных губерний России.