Фамилия Шлушкова — редкий пример, где окончание -ов/-ев не указывает на прямое отчество, а скорее маскирует прозвище, связанное с ремеслом или занятием. В основе лежит слово «шлушка» — так в северо-западных русских говорах (псковских, новгородских) называли челнок ткацкого станка, а также небольшую лодку-долблёнку. Человек мог получить прозвище Шлушка за сходство с этим предметом — например, за худобу и подвижность, или за то, что работал ткачом, лодочником, перевозчиком.

Мужская форма фамилии — Шлушков. Суффикс -ов типичен для русских фамилий, образованных от основ на твёрдый согласный, и здесь он выполняет обычную притяжательную функцию: «чей? — Шлушков», то есть сын или потомок Шлушки. Женская форма Шлушкова следует тому же правилу.

Версия о связи с диалектным «шлушка» — основная и наиболее правдоподобная. Менее вероятно происхождение от личного имени Шлуш (если такое и существовало, то крайне редко) или от искажённого заимствования. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) эта фамилия не упоминается, что подтверждает её локальный и немногочисленный характер.

Географически фамилия Шлушкова встречается в Псковской и Новгородской областях, реже — в Тверской. Это согласуется с ареалом слова «шлушка»: в центральных и южных говорах его не знали. Социальный состав носителей — в основном крестьяне и ремесленники, что типично для прозвищных фамилий, не связанных с дворянскими родами.

Таким образом, Шлушкова — фамилия, которая прямо отсылает к ткацкому или лодочному делу предков. Если ваш предок был Шлушкой, он мог быть либо ткачом, либо перевозчиком на маленькой лодке, либо просто получить прозвище за внешнее сходство с челноком.