Фамилия Шлюпнева — женская форма мужской фамилии Шлюпнев. Её происхождение неочевидно, и здесь сталкиваешься с редким случаем, когда корень почти не встречается в других русских фамилиях. Основа «шлюпн-» не связана ни с одним распространённым древнерусским именем или прозвищем, что заставляет искать объяснение в диалектной лексике или профессиональной среде.

Самая вероятная версия отталкивается от слова «шлюпка» — небольшое гребное или парусное судно. В русском языке это слово известно с петровских времён, пришло из нидерландского sloep. Прозвище Шлюпа или Шлюпка могли дать человеку, связанному с лодками: лодочнику, перевозчику, рыбаку, мастеру по ремонту судов. Суффикс -н- в основе Шлюпнев указывает на притяжательную модель: «чей?» — Шлюпнев, то есть сын или потомок Шлюпни (или Шлюпного). Такая словообразовательная цепочка характерна для фамилий, возникших из прозвищ по роду занятий.

Менее убедительна, но возможна версия от глагола «шлюпать» — в некоторых говорах это означает «шлёпать по воде», «идти вразвалку» или «плестись». Тогда Шлюпня — прозвище человека с характерной походкой. Однако эта гипотеза слабее, так как глагол редок и не дал устойчивых прозвищ в письменных источниках.

Фамилия Шлюпнева географически привязана к центральным и северо-западным областям России, где развито речное судоходство и рыболовство. Встречается в Тверской, Новгородской, Псковской и Ярославской губерниях. В XIX веке носители фамилии числились в основном среди государственных крестьян и мещан, то есть людей, живших вблизи рек и озёр. Это косвенно подтверждает «лодочную» версию.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шлюпкин, Шлюпников — показывает, что все они образованы от одного корня и, скорее всего, имеют единую профессиональную основу. Шлюпнева стоит в этом ряду как наиболее распространённая форма с суффиксом -ев, типичным для русских фамилий на согласный.