Фамилия Шмерего — одна из тех, что сразу выдают западное, а точнее, украинское или белорусское происхождение. Её выдает финаль -его, которая характерна для фамилий, образованных от прозвищ с помощью суффикса прилагательного. В русском языке эта модель редка, зато в украинском и белорусском встречается чаще, особенно на западе этих земель.

Основа фамилии — «шмерег» или «шмерь». Самое прямое объяснение — от диалектного названия насекомого. В некоторых говорах «шмерег» (или «шмерека») — это шмель или, реже, слепень. Прозвище Шмерего мог получить человек, похожий на шмеля: коренастый, мохнатый, с густым басом, или, напротив, назойливый и «жалящий». Впрочем, не исключено и другое, более редкое значение: в польском языке «szmer» означает «шорох», «шелест». Тогда прозвище могло относиться к тихому, незаметному человеку.

Суффикс -его — это застывшая форма родительного падежа прилагательного, типичная для украинских фамилий на -его (Терещенко, Шевченко — не путать, там другое). В фамилии Шмерего она указывает на принадлежность: «чей?» — шмерегов, то есть «сын Шмерега». Таким образом, фамилия изначально была отчеством: Шмерего — сын (или потомок) человека по прозвищу Шмерег.

Географически фамилия тяготеет к западноукраинским и, возможно, белорусским землям, где такие модели словообразования были распространены. Встречается она нечасто, что говорит о локальном, а не широком бытовании прозвища. Скорее всего, предок носителя фамилии жил в небольшом селе на Волыни, Подолье или в Галиции, и его прозвище закрепилось за потомками без изменений, миновав стадию «обрусения» суффикса.

Редкий суффикс и неочевидная основа делают фамилию Шмерего интересным объектом для ономастики. Она не связана с дворянскими родами или известными историческими личностями, а представляет собой живую народную модель, где человеку дали кличку по внешности или поведению, и она стала фамилией.