Фамилия Шмсунов — редкий случай, когда написание ставит больше вопросов, чем ответов. Сразу бросается в глаза необычное сочетание «шм» в начале, нетипичное для славянских фамилий. Если отбросить суффикс -ов (указывающий на принадлежность: «чей?» — сын Шмсуна), остается основа «Шмсун». Такого имени или прозвища в русской ономастике нет, а значит, корень, скорее всего, иноязычный.

Самая вероятная версия — искажение при записи. В XIX — начале XX века фамилии нередко фиксировали на слух, особенно если носитель говорил с акцентом или писарь был малограмотен. Шмсунов мог возникнуть из фамилии Шамсунов (от арабского имени Шамс — «солнце», распространенного у татар, башкир и народов Кавказа). При быстром произношении или в документе с пропущенной гласной «а» превратилось в «Шмсунов». Вторая версия — тюркская основа «шым» (тихий, спокойный) с суффиксом -сун, но это менее правдоподобно, так как модель «шым + сун» нехарактерна для тюркских антропонимов.

Географически фамилия встречается единично, в основном на юге России и в Поволжье — регионах, где веками жили татары и башкиры. Это косвенно подтверждает связь с тюрко-мусульманским именем. Если предки Шмсуновых были крещеными татарами или башкирами, фамилию могли образовать от личного имени Шамсун (уменьшительная форма от Шамсетдин или Шамсулла), а при русификации потерялась начальная гласная.

Социальный контекст: в отличие от дворянских или купеческих фамилий, Шмсунов не фиксируется в родословных книгах. Скорее всего, предки — крестьяне или мещане, получившие фамилию после отмены крепостного права или в советское время при паспортизации. Единственное, что можно сказать с уверенностью: носителям фамилии стоит искать корни не в древнерусских прозвищах, а в тюркских или арабских именах, переосмысленных русской письменностью.