Фамилия Шнякова — женская форма от Шняков, и в её основе лежит слово, которое в современном языке почти забыто. Корень «шняк» в старину имел два основных значения, и оба могли дать прозвище, ставшее фамилией.

Первое и самое вероятное: «шняк» — это диалектное название рыбацкой лодки, распространённое на Русском Севере, особенно в Поморье и на Белом море. Шняка была небольшим парусно-гребным судном для прибрежного лова. Если предка прозвали Шняком, он мог быть либо владельцем такой лодки, либо рыбаком, ходившим на ней, либо мастером-лодочником. География фамилии это подтверждает: Шняковы традиционно встречаются в Архангельской, Вологодской областях и в Карелии — там, где поморский промысел был основой жизни.

Второе, менее распространённое значение: в некоторых говорах «шняк» означало нечто мелкое, незначительное, либо, наоборот, неряшливого, неопрятного человека. Прозвище могло закрепиться за невысоким или небрежным в одежде человеком. Однако версия с лодкой выглядит убедительнее: она даёт ясную профессиональную привязку, а фамилии от названий ремёсел и орудий труда — один из самых частых типов русских фамилий.

Суффикс -ов указывает на принадлежность: Шняков — сын или потомок Шняка. То есть фамилия отчество-прозвищная, а не от крестильного имени. Встречается она нечасто, что тоже говорит в пользу узкорегионального, диалектного происхождения. В XIX веке носители фамилии числились в основном государственными крестьянами и мещанами северных губерний.

Таким образом, если ваши предки — Шняковы, с высокой вероятностью они были связаны с морем или рекой: рыбачили, строили лодки или жили на побережье Белого моря. Фамилия хранит в себе память о старом поморском слове, которое сегодня почти вышло из обихода.