Фамилия Шнякин образована от прозвища Шняка. Оно ведет свое начало от аналогичного нарицательного со значением «небольшое плоскодонное беспалубное парусное рыболовное судно». Вероятно, такое прозвище могли дать рыбаку или судостроителю. Соответственно, прозвище Шняка относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на деятельность основателя фамилии. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Шняка, со временем получил фамилию Шнякин.