Фамилия Шокилбаева — яркий пример антропонимической модели, распространённой у тюркских народов Центральной Азии, в первую очередь у казахов. Её разбор сразу даёт ответ на вопрос о происхождении: основа здесь — мужское личное имя Шокилбай, а суффикс -ев/-ева указывает на принадлежность («чей?»), то есть «дочь (или жена) Шокилбая». Женская форма фамилии закономерна для носительницы, а мужской вариант — Шокилбаев.

Корень имени Шокилбай составной. Первая часть — «шокыл» (в разных тюркских языках может звучать как «шокыр», «шокар»), что означает «рябой», «пёстрый» или «с отметиной». В казахской антропонимии такие имена давали детям с родимыми пятнами, веснушками или просто для «отвода глаз» — считалось, что некрасивое имя убережёт ребёнка от сглаза. Вторая часть — «бай» — типичный компонент традиционных имён, означающий «богатый», «господин», «хозяин». Таким образом, Шокилбай дословно переводится как «рябой богач» или «пёстрый хозяин», но в реальности это было пожелательное имя-оберег.

Словообразовательный суффикс -ев, а не казахский -ұлы или -қызы, подсказывает, что фамилия оформилась уже в русской канцелярской традиции — в период переписи населения и паспортизации в XIX–XX веках. Именно тогда тюркские отчества стали записывать по русскому образцу, закрепив за родом фамильную форму.

Фамилия редкая, её географический центр — южные и западные регионы Казахстана, где распространён родоплеменной суффикс «шокыл» среди казахов. Встречается также в Кыргызстане и Узбекистане, но в меньшем числе. Других версий происхождения (например, от арабского или персидского корня) нет — тюркская основа и модель образования здесь очевидны.