Фамилия Шолданенко — редкий случай, когда суффикс и основа вступают в лёгкое противоречие, давая ключ к географии и происхождению. Суффикс -енко однозначно указывает на украинскую модель образования фамилий (вторую по распространённости после -ов/-ев). Такие фамилии в массе своей возникли в Поднепровье, Слобожанщине и на юге современной Украины в XVI–XVII веках. Однако корень «Шолдан» — нетипичен для украинской лексики.

Здесь, скорее всего, мы имеем дело с фамилией, образованной от прозвища Шолдан. Само слово «шолдан» в украинских и южнорусских говорах могло означать «шумный, крикливый человек», «задира» или «буян». В некоторых источниках встречается значение «непоседа», «ерш» — человек, который постоянно в движении, создаёт суету. Есть и другая, менее распространённая версия: «шолдан» — искажённое тюркское «солтан» (султан), которое могло закрепиться как прозвище для гордого или властного человека, но эта гипотеза слабее, так как в украинской среде фамилии с корнем «султан» обычно сохраняют прямое звучание (Султаненко, Султанов).

Таким образом, предок носителя фамилии Шолданенко был человеком с живым, возможно, взрывным характером, за что и получил прозвище Шолдан. А уже его сына или внука в официальных документах записали как Шолданенко — буквально «сын Шолдана». Интересно, что если бы фамилия формировалась в северных русских землях, она бы звучала как Шолданов. Форма на -енко чётко фиксирует южное, украинское происхождение рода. В современных украинских фамилиях этот корень встречается редко, что делает Шолданенко неочевидной, но исторически прозрачной фамилией: она рассказывает о предке, который выделялся среди окружающих не ремеслом и не местом жительства, а своей натурой.