Фамилия Шомисова — редкий случай в русской ономастике, где женская форма стала исходной для целого рода. Обычно фамилии на -ов/-ев образуются от мужских имён или прозвищ, но здесь основа — женское имя Шомиса. Это диалектный вариант крестильного имени Шемасия (от древнееврейского «Шемайя» — «Господь услышал»). В русских говорах имя упростилось: отпали конечные слоги, появилось привычное окончание -а, а начальное «Ше» перешло в «Шо» под влиянием аканья — так Шемасия превратилась в Шомису.

По модели образования фамилия типична для северных и центральных областей России, где были распространены «матронимы» — фамилии от имени матери. Если женщина оставалась главой семьи (например, после смерти мужа или в отхожих промыслах), детей могли записать по ней. Шомисовы, скорее всего, потомки вдовы или одинокой матери по имени Шомиса, которая вела хозяйство в XVI–XVII веках. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «чей?» — Шомисов, то есть сын или потомок Шомисы.

Встречается фамилия крайне редко, в основном в Вологодской и Архангельской областях — именно там старообрядческие общины дольше сохраняли архаичные имена. В метрических книгах XIX века можно найти запись о крестьянине из Шенкурского уезда, где отчество «Шомисов» ещё не стало фамилией, а указывало на прямое родство. Со временем форма закрепилась, и сейчас Шомисова — это не просто «женская версия», а исторический след того, как имя матери становилось родовым именем.

Интересно, что в других славянских языках аналогов почти нет. Украинская фамилия Шомис — тоже редкая, но там корень мог быть другим, от прозвища «шомис» (болтун, пустомеля). Для русской же фамилии версия с именем Шомасия — основная и подтверждается ономастическими справочниками по северным говорам.