Фамилию Шомытов стоит разбирать не с корня, а с суффикса. Формант -ов указывает на классическую русскую патронимическую модель: так называли сына или потомка человека по имени или прозвищу Шомыт. Сама основа фамилии — «Шомыт» — не встречается в современных календарных святцах, а значит, перед нами не церковное, а мирское прозвище.

Самая прямая версия отсылает к диалектному слову «шомыть». В северных и сибирских говорах глагол «шомыть» означал «шуметь, возиться, суетиться», а также «шарить, рыться, искать». Шомытом могли прозвать непоседливого, беспокойного человека, который вечно копошится и создаёт суету. В некоторых говорах слово имело более конкретный оттенок — «шомыга» или «шомыка» значило «бродяга, шатун». Тогда прозвище носило не столько характерный, сколько социальный оттенок: так могли назвать человека без постоянного места или занятия.

Есть и более узкая, ремесленная версия. В диалектах встречается слово «шомыть» в значении «мыть, полоскать» (с чередованием ш/с — от общеславянского *sъmyti). В этом случае Шомытом могли называть работника, занятого мытьём чего-либо — например, посуды в трактире или руды на промысле. Однако эта версия менее вероятна: глагол «мыть» в русском языке устойчив, и форма «шомыть» — редкое диалектное ответвление.

В ономастических справочниках фамилия Шомытов не упоминается среди массовых, но её география показательна. Основные очаги — Вологодская, Архангельская и Кировская области, что подтверждает севернорусское происхождение основы. Встречаются также варианты написания Шамытов (с аканьем) и реже Шемытов, но основная форма устойчиво закрепилась через «о».

По сословной принадлежности ничего определённого сказать нельзя: фамилия не дворянская и не купеческая, её носители в прошлом — скорее всего, крестьяне или посадские люди Русского Севера, где фамилии на -ов складывались позже, чем в центральных губерниях, но нередко сохраняли яркие диалектные прозвища. Шомытов — фамилия, которая прямо выводит на характер или род занятий предка, и в этом её ценность для историка семьи.