Фамилия Шоненко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, которая в XVII–XVIII веках была распространена в Поднепровье, на Слобожанщине и в Запорожье. Суффикс -енко изначально имел значение «маленький» или «сын кого-то», поэтому Шоненко — это «сын Шона» или «потомок Шона». Основа «Шон» не является славянским именем, что сразу указывает на нестандартное происхождение.

Вероятнее всего, в основе лежит тюркское или кавказское имя Шон (варианты — Шона, Шонур). В тюркских языках «шон» может означать «слава», «известность». Попасть в украинскую среду такое имя могло через казачество: запорожцы часто контактировали с крымскими татарами, ногайцами, черкесами, и нередко брали себе прозвища или имена из этих языков. Менее вероятна, но возможна связь с английским именем Шон (ирландское Sean), которое в XIX веке могли принести в Малороссию иностранные специалисты или купцы — но это единичные случаи.

География фамилии подтверждает украинские корни: по данным переписей XIX–XX веков, Шоненко встречается преимущественно в Черкасской, Полтавской и Киевской областях. Это регионы, где суффикс -енко был доминирующим. Сословно носители фамилии относились к казацкой старшине или мещанам, реже — к крестьянам, но чёткого дворянского статуса не зафиксировано.

Обратите внимание на написание: фамилия пишется с буквой «е» в суффиксе (Шоненко, а не Шо́нко). Это типично для фамилий, образованных от полного имени, а не от сокращённой основы. Если бы предка звали просто Шон, то фамилия могла бы стать Шонов или Шонин, но модель на -енко жёстко привязывает носителя к украинской антропонимической традиции.

Таким образом, Шоненко — редкий случай, когда тюркское по происхождению имя попало в украинскую фамильную систему через казацкую среду. Носитель этой фамилии, скорее всего, потомок запорожца, получившего прозвище Шон за связь со степными народами или за внешность.