Фамилия Шопхоева звучит непривычно для русского уха, но её происхождение довольно прозрачно. Она явно образована от мужского имени или прозвища Шопхой. В основе лежит тюркская или монгольская лексика, что указывает на бурятские, калмыцкие или, возможно, алтайские корни носителей. Первая часть «шоп» (или «шо») в тюркских языках может означать «слава», «честь», «имя», а «хой» — «овца» или «баран». Однако более вероятно, что Шопхой — это личное имя, сложенное из двух основ, где второй компонент («хой») в некоторых тюркских и монгольских языках выступает как ласкательный или уменьшительный суффикс, придающий имени оттенок «дорогой», «милый». Таким образом, прозвище Шопхой могло означать «славный», «почётный» или даже «красавчик».

Фамилия образована по русской модели с помощью патронимического суффикса -ев (после мягкого согласного). Форма Шопхоева — женская, мужской вариант — Шопхоев. Суффикс -ев, как и -ов, указывает на принадлежность к роду: буквально «дочь (или жена) Шопхоя». Такая модель характерна для фамилий, которые возникли в среде, где русское влияние смешивалось с местными традициями именования. В бурятской и калмыцкой среде фамилии часто закреплялись в XIX—XX веках при оформлении документов, когда родовые имена переводили в русскую патронимическую форму.

Стоит обратить внимание на редкий суффикс -оев (а не -ов), который встречается в фамилиях народов Сибири и Центральной Азии. Он придаёт фамилии характерный колорит и сразу выдаёт её нерусское происхождение. Фамилия Шопхоева географически тяготеет к Бурятии, Иркутской области и Забайкальскому краю, где распространены подобные антропонимы. Встречается она редко, что говорит о том, что род Шопхоевых, скорее всего, не был многочисленным, а имя-основа сохранилось в памяти лишь одной ветви.

Социальный статус предков Шопхоевых, вероятнее всего, был связан с кочевым скотоводством или охотой. В бурятской традиции личные имена часто давали по внешним признакам, чертам характера или событиям при рождении. Если имя Шопхой действительно означало «славный», то его мог получить ребёнок, родившийся в удачное время или в зажиточной семье. Никаких документальных подтверждений дворянского происхождения этой фамилии нет — это типичная крестьянская или казачья фамилия, закрепившаяся в среде коренных народов Прибайкалья.