Фамилия Шопыгина — женская форма фамилии Шопыгин, а та, в свою очередь, образована по «классической» русской модели от прозвища Шопыга. Ключ к разгадке — в основе «шоп-», которая звучит нехарактерно для славянского корнеслова. Здесь почти наверняка скрывается не русское, а тюркское или финно-угорское влияние, что сразу выделяет эту фамилию из ряда «стандартных» на -ов и -ин.

Самый правдоподобный вариант: прозвище Шопыга связано с диалектным словом «шопка» — так в некоторых южнорусских и украинских говорах называли шляпу, шапку, головной убор. Человек по прозвищу Шопыга мог быть тем, кто носил заметную, необычную шапку, либо занимался её изготовлением — то есть шапочником, скорняком. Суффикс «-ыга» в прозвищах (ср. Бродяга, Работяга) придаёт слову оттенок просторечия, «обиходности», поэтому Шопыга — не официальное имя, а уличное, бытовое прозвище.

Вторая, менее вероятная версия — тюркская. В языках Поволжья (чувашский, татарский) есть слово «шоп» (сор, мусор, отходы) или основа «шоп-» со значением «мести». Такое прозвище могло закрепиться за человеком, который работал с отходами, либо за неряшливым, «сорным» человеком. Однако эта версия слабее: географически фамилия Шопыгины встречается в основном в русских регионах (Вологда, Архангельск, Киров), а не в татарской среде, поэтому «шапочная» этимология выглядит предпочтительнее.

Фамилия закрепилась на Русском Севере и в Вятке. В «Ономастиконе» Веселовского упоминаний Шопыгиных нет, что говорит о её относительно позднем оформлении — скорее всего, не раньше XVII века. Суффикс «-ин» указывает на принадлежность: Шопыгин — «сын Шопыги». Таким образом, предок носительницы этой фамилии был, по всей видимости, либо шапочником, либо человеком, которого в деревне прозвали за его головной убор.