Фамилия Шоворгина — женская форма фамилии Шоворгин, и её происхождение стоит искать в мужском прозвище или имени, лёгшем в основу. Словообразовательная модель проста: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — сын или потомок Шоворги). Основа — «шоворг-», и вот здесь начинается самое интересное.

Корень «шоворг» не является общеупотребительным в современном русском языке. Скорее всего, он восходит к диалектному или устаревшему слову. В русских говорах, особенно северных и вологодских, зафиксировано слово «шоворгать» — шуршать, шевелиться, производить шорох. От него могло образоваться прозвище Шоворга — для человека суетливого, непоседливого, или того, кто при ходьбе издавал характерный звук (например, шаркал ногами). Прозвища по манере поведения — один из древнейших пластов русских фамилий.

Менее вероятная, но возможная версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В некоторых тюркских языках есть слова, близкие по звучанию, означающие «кривой», «косой» или «изогнутый». Однако для фамилии, бытующей в центральной России, славянская диалектная основа выглядит убедительнее. Сравните с однокоренными фамилиями Шоворков, Шовыркин — они встречаются в тех же регионах и подтверждают живую словообразовательную гнезду.

Фамилия редкая. По данным открытых источников, носители фамилии Шоворгины (и Шоворгина) исторически концентрируются в Вологодской, Костромской и Кировской областях. Это хорошо совпадает с ареалом севернорусских говоров, где слово «шоворгать» было в ходу. Значит, предки Шоворгиных — скорее всего, крестьяне или посадские люди Русского Севера, получившие фамилию по прозвищу, которое дали одному из родоначальников. Никакого знатного или служилого происхождения у этой фамилии нет — перед нами чисто народная, «говорящая» фамилия, описывающая человека по его характерной черте.