Фамилия Шойнов — одна из тех, где корень на первый взгляд очевиден, а на деле ведёт в разные стороны. В ней отчётливо слышится основа «шойн-», но что она значила для человека, получившего такое прозвище, — вопрос, на который нет одного ответа.

Самый простой и частый путь — от имени собственного. В крестьянской среде фамилии нередко образовывали от уменьшительных форм крестильных имён. Имя Шой могло быть просторечным вариантом имени Шойн — краткой формы от Шойна, в свою очередь восходящей к каноническому имени Шио (грузинского происхождения, в святцах — преподобный Шио Мгвимский). На русской почве такие имена адаптировались, давая целые гнёзда фамилий: Шинов, Шиянов, а через народное произношение — и Шойнов. Если так, то предок носителя фамилии был просто Шой, то есть Шио, а суффикс -ов указал на принадлежность: «чей?» — Шойнов сын.

Но есть и другая версия, более прозаическая. В некоторых говорах (особенно северных и сибирских) «шой» или «шойка» означало щепу, стружку, мелкий мусор, а также — неопрятного, небрежного человека. Прозвище Шой или Шойня могли дать тому, кто работал с деревом и был весь в стружке, или, наоборот, неряхе. Сравните с фамилией Щепкин — модель та же, только материал разный. В пользу этой версии говорит и то, что фамилия встречается в регионах, где было развито лесное хозяйство и деревообработка, например, в Архангельской и Вологодской губерниях.

Менее вероятно, но логически возможно, что основа восходит к тюркскому «шой» — род, племя, сословие. В таком случае прозвище могло указывать на знатное происхождение или принадлежность к определённой социальной группе. Однако для русских фамилий этот вариант маргинален: тюркские заимствования в основе обычно касаются конкретных предметов или качеств, а не абстрактных категорий.

География фамилии Шойнов довольно широка, но без резких «столичных» перекосов. Она встречается и в центральной России, и в Поволжье, и на Урале. Это говорит о том, что фамилия возникла не в одном гнезде, а в разных местах независимо — что характерно для «простых» прозвищных фамилий. Сословно предки Шойновых, скорее всего, были крестьянами или ремесленниками: ничто в фамилии не указывает на дворянство или духовенство.

Итак, наиболее правдоподобно, что Шойнов — это фамилия, образованная либо от народной формы имени Шио, либо от прозвища, связанного с щепой и стружкой. Первый вариант универсальнее, второй — колоритнее и точнее привязан к быту. Выбор между ними зависит от семейной истории: если в роду были плотники или лесорубы, версия с «щекой» становится почти очевидной.