Фамилия Шторфунов — редкая и по звучанию, и по происхождению. Если посмотреть на её основу, сразу бросается в глаза, что она не вписывается в ряд исконно русских прозвищ от ремёсел, растений или черт характера. Скорее всего, перед нами фамилия искусственная, книжная, возникшая в среде духовенства.

Модель образования типична для русской фамилии: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей сын?» — Шторфунов). А вот корень «Шторфун» — главная загадка. В русском языке нет такого слова. Наиболее вероятная версия связывает его с латинским словом strophium (повязка, нагрудник) или греческим στρόφιον (пояс, бинт). В семинарской среде было принято давать будущим священникам «говорящие» фамилии на латыни или греческом, часто переводя фамилию отца или его прозвище на древний язык.

Вторая, менее правдоподобная, но возможная версия — искажение немецкой фамилии. Немецкое слово Stoff (материя, ткань) или фамилия Storff могли при заселении в Россию получить русский суффикс -ун, характерный для прозвищ (например, говорун, крикун), а затем и фамильный -ов. Однако такой путь дал бы скорее Шторфов или Шторфун, а не Шторфунов.

Третья, совсем слабая гипотеза — связь с диалектным словом «шторф» (сорт крепкого пива или плотная шёлковая ткань). Но ни в одном известном словаре русских говоров подобного прозвища не зафиксировано.

Географически фамилия тяготеет к центральным и южным регионам России, что косвенно подтверждает её семинарское происхождение — именно там были сильны духовные училища, практиковавшие такие переименования. Носители фамилии Шторфунов, скорее всего, потомки священно- или церковнослужителей, получивших звучную, «учёную» фамилию при поступлении в семинарию. Это редкий случай, когда фамилия говорит не о ремесле предка, а о том, что его отец или дед носил рясу.