Фамилия Шубнов — одна из тех, что образована напрямую от названия профессии, без промежуточных имён и прозвищ. В основе лежит слово «шубник» — мастер, который шил шубы и другую верхнюю меховую одежду. В русских говорах «шубником» называли не только скорняка, но и торговца меховыми товарами. Суффикс -ов в фамилии указывает на принадлежность: Шубнов — это буквально «сын шубника», «из семьи шубника». Модель образования здесь простейшая и прозрачная: основа на -н (шубник) даёт фамилию Шубников, но в разговорной речи или при усечении суффикса -ик получилось Шубнов. Встречается и параллельная форма Шубников, которая встречается чаще, но Шубнов — не ошибка, а вариант, закрепившийся в документах.

Интересно, что фамилия могла возникнуть и от прозвища Шубный — так могли назвать человека, который постоянно ходил в шубе, или владельца дорогой меховой одежды. Но первая версия, ремесленная, для этой фамилии правдоподобнее: в крестьянской и посадской среде фамилии от названия занятия — самый частый путь. Шубновы не были дворянами, это фамилия людей «низовых» сословий: ремесленников, мещан, позже — крестьян, получивших фамилию после отмены крепостного права. Географически фамилия встречается в центральных и северных областях России, где скорняжный промысел был развит: в Костромской, Вологодской, Ярославской губерниях. Там выделка кож и шитьё меховой одежды кормили целые деревни.

В ономастике фамилию Шубнов обычно не относят к редким, но и не считают массовой. Она не имеет отношения к слову «шуба» в переносном смысле (шуба как защита, слой снега) — это позднее бытовое значение, которое не повлияло на антропонимию. Спорных версий происхождения практически нет: и корень, и суффикс очевидны. Единственный нюанс — возможное смешение с фамилией Шубин, которая образована от нецерковного имени Шуба, но Шубнов стоит особняком, и путать их не стоит.