Фамилия Шухлинский — одна из тех, что хранит в себе сразу несколько загадок. Она образована с помощью суффикса -ский, который в русской ономастике чаще всего указывает на географическое происхождение: так называли человека по названию местности, откуда он родом. В основе фамилии лежит топоним — скорее всего, село или деревня с названием Шухлино, Шухлинка или Шухлы. Такие названия встречаются в разных регионах, но особенно характерны для запада России, Украины и Белоруссии, где суффикс -ский прижился в дворянской и шляхетской среде. Однако носителем фамилии мог быть и крестьянин, переселившийся в другое место и получивший прозвание по покинутой деревне.

Сложнее с корнем «шухл-». Слово «шухлый» в русских говорах имеет два значения. В одних диалектах (владимирских, ярославских) «шухлый» — это хилый, тщедушный, болезненный человек. В других, особенно в псковских и тверских говорах, «шухлый» означает «гнилой», «затхлый», «трухлявый» (о дереве или сене). Прозвище Шухля или Шухло могли дать либо слабому здоровьем человеку, либо тому, кто жил в сырой, подгнившей избе или работал с некондиционным материалом. Прямой связи с ремеслом здесь нет, скорее — с бытовой характеристикой.

Версия о происхождении от личного имени Шуха (уменьшительное от Шура, Александр) или от тюркского «шух» (весёлый, бойкий) менее убедительна. В первом случае фамилия звучала бы как Шухин или Шухов, а во втором — суффикс -ский для тюркских заимствований нехарактерен. Поэтому географическая основа с диалектным прозвищным корнем — самое вероятное объяснение.

В украинском и польском контексте фамилия Шухлинский могла возникнуть и от названия населённого пункта Шухли (например, в Волынской области). Там суффикс -ський (-ski) — обычный для местных фамилий, и носители таких фамилий часто принадлежали к мелкой шляхте или зажиточным крестьянам. В России же, особенно в центральных губерниях, Шухлинские встречаются реже, и их родословная чаще уходит в духовное сословие или в среду однодворцев.

Социальный состав носителей фамилии неоднороден. В XIX веке Шухлинские фиксируются и в купеческих списках, и среди крестьян, и в среде сельских священников. Точных данных о дворянстве этой фамилии нет — она не входит в «Бархатную книгу» или родословные сборники, но отдельные ветви могли получить личное дворянство по выслуге или образованию.