Фамилия Шухобов — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка связано с особенностью речи. В русских говорах слово «шухобой» или «шухобот» означало «шепелявый», «картавый» человек, то есть тот, кто говорит невнятно, «шухобит». Корень здесь звукоподражательный, близкий к «шу-шу» — шёпоту или неразборчивому бормотанию. Таким образом, первый носитель прозвища Шухоб, скорее всего, получил его от окружающих за манеру выговаривать слова.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе на твёрдый согласный (Шухоб) добавляется патронимический суффикс -ов, означающий «сын Шухоба» или «из рода Шухоба». Если бы основа оканчивалась на -а или -я, фамилия выглядела бы как Шухобин, но в данном случае перед нами классическая «овская» форма, распространённая в центральной России и на севере.

Стоит отметить, что слово «шухобой» имело и переносное значение — «бестолковый», «путаный» человек. Однако, как и в случае с большинством древних прозвищ, негативный оттенок со временем стёрся, и фамилия закрепилась как нейтральный родовой знак. Поскольку прозвище фиксирует индивидуальную черту, а не профессию или место жительства, предки Шухобовых могли быть крестьянами или посадскими людьми из северных или центральных губерний — именно там диалектное слово «шухобить» было в ходу.

В письменных источниках фамилия встречается нечасто, что подтверждает её диалектную природу. В метрических книгах XIX века Шухобовы изредка попадаются в Ярославской и Костромской губерниях — регионах, где говор отличался обилием «окающих» и шепелявых форм. Сравните с однокоренными фамилиями Шухов, Шухин — они образованы от того же звукоподражательного корня, но с другим суффиксальным оформлением. Шухобов же сохранил редкий диалектный суффикс -об-, что делает его особенно ценным для лингвистов как свидетельство живой народной речи.