Фамилия Шухобова — женская форма фамилии Шухобов, и её происхождение неочевидно на первый взгляд. В ней нет привычного суффикса -ин или -ов, указывающего на принадлежность отцу; здесь мы видим суффикс -ов, но основа нестандартная. Ключ к разгадке — в диалектном слове «шухоба» или «шухобный». В северных и сибирских говорах «шухоба» означала беспорядок, суету, переполох, а «шухобный» — суетливый, беспокойный человек. Прозвище Шухоба могли дать непоседе, тому, кто вечно суетится или создаёт шум.

Словообразовательная модель проста: от прозвища Шухоба через притяжательное прилагательное «Шухобов сын» (то есть сын Шухобы) образовалась фамилия Шухобов. Суффикс -ов здесь стандартный, указывающий на принадлежность. Гораздо реже, но теоретически возможна связь с топонимом: например, в Тверской области есть деревня Шухобово. В таком случае фамилия могла произойти от названия места, где жил предок, но это менее вероятно — прозвищная версия встречается чаще.

В исторических документах фамилия встречается в основном в центральных и северных губерниях России. Известны крестьяне Шухобовы из Вологодской и Костромской губерний, что хорошо согласуется с диалектной географией слова «шухоба». Фамилия редкая, не аристократическая: её носители в подавляющем большинстве были крестьянами или мещанами. Сословных привилегий она не давала, зато сохранила живое, образное прозвище, которое в XIX веке ещё помнили как обидное или шутливое.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Шухин, Шухов — показывает, что «шух» могло быть и самостоятельным корнем, означающим «пустой, вздорный» (ср. «шухры-мухры»). Но именно форма Шухобова уникальна тем, что сохранила полную диалектную основу, а не усечённый вариант. Так что, скорее всего, предок носительницы этой фамилии был человеком бойким, неспокойным — и это закрепилось в фамилии на века.