Фамилия Шулутко — одна из тех, что сразу выдают географию своего происхождения. Она почти наверняка имеет еврейские корни и образована на территории, где в XIX — начале XX века говорили на идише. Характерный суффикс -ко (вместо более привычного русского -ов или -ин) указывает на украинское или белорусское влияние: так оформляли фамилии в черте оседлости, особенно на Волыни, Подолье и в Бессарабии.

Основа фамилии — шулут (идиш שלות, shules). Это слово означает «мир», «покой», «благополучие», а в некоторых диалектах — ещё и «власть» или «господство». То есть Шулутко — это «сын (или потомок) Шулута», человека, которого прозвали за спокойный нрав или, наоборот, за властность. Встречается и другое прочтение: от ивритского шалом (мир), но через идишную огласовку форма «шулут» более вероятна.

Суффикс -ко в еврейских фамилиях часто выполнял роль уменьшительного или патронимического (указывал на принадлежность). В паре с основой «шулут» он даёт значение «маленький Шулут» или «потомок Шулута». Такая модель типична для фамилий, записанных чиновниками Российской империи при переписях: им было проще прикрепить местный суффикс к услышанному прозвищу, чем разбираться в тонкостях произношения.

Встречается фамилия в двух основных написаниях: Шулутко и Шулудько (с озвончением «т» перед «к»). Второй вариант — результат живой речи, когда глухой звук в потоке становится звонким. Оба варианта считаются корректными и восходят к одному корню.

Сословно носители фамилии относились к мещанам и купцам — в основном это были ремесленники, мелкие торговцы, управляющие. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано. В современной России и Украине Шулутко встречается редко, но стабильно: несколько сотен семей, разбросанных от Одессы до Москвы, с заметным пятном в Кишинёве и бывшей Бессарабской губернии.