Фамилия Шупегин — характерный пример «профессиональной» русской фамилии, образованной от прозвища предка. В её основе лежит слово «шупега» или «шупег» — так в некоторых русских говорах называли шубу или полушубок, а также человека, который их шил или торговал ими. Иными словами, Шупегин — это потомок скорняка, овчинника или меховщика.

Словообразовательная модель проста и типична для северных и центральных областей России: суффикс -ин указывает на принадлежность («чей?» — Шупегин, то есть сын или потомок Шупеги). Сама основа «Шупега» — это прозвище, данное по роду занятий или по характерной одежде. В говорах Вологодской, Архангельской и Костромской губерний слово «шупега» означало именно короткую меховую шубу, что делает географию фамилии достаточно узкой и привязанной к Русскому Северу.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые чаще образовывались от полных церковных имён (Иванов, Петров), фамилии на -ин нередко возникали от прозвищ, оканчивающихся на -а, -я. Шупегин стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Сапожников (от «сапожник») или Телегин (от «телега»), но если у тех основа прозрачна, то «шупега» — слово диалектное, вышедшее из активного употребления. Это делает фамилию интересным маркером регионального говора и быта.

Встречается и альтернативная, менее правдоподобная версия: связь с личным именем Шупег — якобы производным от канонического имени Силуан (через народную форму «Шупило»). Однако эта гипотеза слабо подтверждена, так как в словарях древнерусских имён такое имя не фиксируется, а связь с ремеслом и одеждой очевидна и подтверждается диалектными данными. Поэтому версия о скорняжном деле остаётся основной.

Таким образом, фамилия Шупегин — это не просто наследственный идентификатор, а отражение конкретного ремесла, распространённого на Русском Севере, и живого народного слова, которое сегодня почти забыто.