Фамилия Шупликова — женская форма мужской фамилии Шупликов. Её основа, скорее всего, связана с прозвищем или именованием Шуплик, а не с диалектным словом «шуплый» (тщедушный, хилый), которое напрашивается первым. В русских говорах, особенно юго-западных и белорусских, «шуплик» могло означать «сопляк», «малорослый человек» или даже «замарашка». Однако более вероятно, что в основе лежит польское или украинское слово «szuplik» (или «шуплик») — так называли деревянный гвоздь, шпунт, затычку. В таком случае прозвище Шуплик давали мастеру, который делал бондарные изделия, или человеку с плотной, коренастой фигурой — по ассоциации с крепко сидящим в доске деревянным шипом.

Суффикс -ов в фамилии Шупликов указывает на типичную для центральной России патронимическую модель: «чей?» — сын Шуплика. Женская форма Шупликова закрепилась в документах, когда фамилию стали передавать по наследству через женскую линию или в качестве семейного именования.

Фамилия редкая и географически привязана к регионам, где исторически пересекались русские, украинские и белорусские говоры — Брянская, Смоленская, Курская области. Встречается она и у потомков переселенцев в Сибирь. В списках однодворцев и крестьян южных уездов XVII–XVIII веков можно найти носителей похожих прозвищ, но письменных свидетельств именно о Шупликовых в дореволюционных ревизских сказках сохранилось немного — это говорит о том, что фамилия не была массовой и, вероятно, возникла в среде ремесленников или мелких служилых людей.

С точки зрения словообразования, фамилия любопытна тем, что сохранила редкую основу без оглушения или смягчения на конце. Если бы прозвище звучало как «Шупляк», фамилия писалась бы через «я» (Шупляков). Вариант с «и» — Шупликов — более архаичный, он лучше сохраняет исходное звучание прозвища.