Фамилия Шуршукова — вариант женского рода от мужской Шуршуков. Чтобы понять её происхождение, нужно разобрать основу — «шуршук». Это слово с характерным звукоподражательным корнем «шурш-», тем же, что в глаголе «шуршать». В русских говорах «шуршуком» или «шуршаком» называли не только шорох, но и сухой лист, траву, а также человека, который издаёт шуршащие звуки или суетливо, беспокойно двигается. Прозвище Шуршук могли дать либо непоседливому, вертлявому человеку, либо тому, кто занимался сбором сухой листвы, сена, соломы — например, крестьянину, работавшему с сеном или мякиной.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: суффикс -ов- (в женском варианте -ова) указывает на принадлежность к роду. Шуршуков — буквально «сын Шуршука» или «из дома Шуршука». Фамилия недворянская, скорее всего, крестьянская или мещанская, что подтверждается её редкой встречаемостью в старых переписных книгах.

По географии фамилия Шуршуков (и Шуршукова) преимущественно встречается в центральных и северных областях России, особенно в Вологодской, Костромской и Архангельской губерниях. Там в местных говорах слово «шуршук» было более употребительным. В словаре русских народных говоров зафиксировано, что в вологодских и архангельских диалектах «шуршун» — это непоседа, а «шурша» — тот, кто возится, шуршит. Так что предки носителей фамилии были, скорее всего, крестьянами или ремесленниками, получившими прозвище по своей манере поведения или занятию.

Встречается также версия, что основа могла быть связана с тюркскими языками, где похожие корни означают «сор» или «мусор», но для русской фамилии Шуршукова это маловероятно — звукоподражательная русская версия подтверждается и диалектными данными, и словообразовательной логикой.