Фамилия Шуйнберг — редкий для России случай немецкого топонимического следа, адаптированного в русской среде. Её основа — немецкое Schönberg, что буквально означает «красивая гора» (от schön — красивый, Berg — гора). В русском произношении и на письме фамилия прошла через характерную замену: немецкое ö передалось как у (сравните с фамилией Мюллер, которая могла писаться как Миллер или Муллер), а конечный мягкий звук отвердел, дав привычное окончание «-берг». Таким образом, исходная фамилия Шёнберг превратилась в Шуйнберг.

Такое написание — не ошибка, а результат практической транскрипции XIX — начала XX века, когда немецкие фамилии записывали на слух, по-русски, часто без учёта оригинальной орфографии. Модель образования — типичная немецкая фамилия-топоним: её давали человеку, жившему у горы Шёнберг или в одноимённом поселении. Таких мест в Германии, Австрии и Швейцарии несколько десятков, и носитель фамилии мог происходить из любого из них. В России и странах бывшего СССР Шуйнберги — это почти всегда потомки немецких колонистов, приглашённых Екатериной II в Поволжье, или выходцев из Прибалтики, где немецкое влияние было сильным.

Словообразовательный анализ показывает, что суффикса, свойственного русским фамилиям, здесь нет: вся конструкция — корень + корень (сложение основ). Это сразу отличает Шуйнберг от подавляющего большинства русских фамилий на -ов, -ин, -ский. В ономастических справочниках (например, в работах Б. Унбегауна по русским фамилиям) такие случаи рассматриваются как заимствования, не менявшие своей структуры при переходе в русский быт. Споров о происхождении практически нет: версия с немецким топонимом единственная и бесспорная. Альтернативные гипотезы (например, от еврейского местечка Шуйне или от славянского корня «шуй» — левый) не выдерживают критики, так как не объясняют компонент «-берг», который в славянских языках отсутствует.

Социальный контекст фамилии — это история немецких крестьян, ремесленников и специалистов, которые в XVIII–XIX веках селились в Российской империи компактными колониями. Шуйнберги не были дворянами (немецкие бароны Шёнберги — другая ветвь, писавшаяся иначе), а принадлежали к трудовому сословию: хлеборобы, мельники, пекари, аптекари. После Первой мировой войны и в советское время многие носители фамилии русифицировали написание, меняя «Шуйнберг» на «Шуйберг» или даже на «Шуйский», но оригинальная форма сохранилась у тех, кто держался за память о немецких корнях.