Фамилия Сигниенко — редкий случай, когда суффикс «-енко» (типичный для украинских фамилий) стоит после основы, которая звучит не по-славянски. Человек, впервые увидевший эту фамилию, скорее всего запнется: «Сигниенко» — как будто что-то среднее между итальянским и польским. На деле разгадка проще.

Суффикс «-енко» в украинской ономастике означает «маленький» или «сын» (как Иващенко — сын Ивана). Основа «Сигни-» не встречается в русских или украинских именах и прозвищах. Самое вероятное объяснение — это фамилия, образованная от прозвища Сигна (или Сигний). А оно, в свою очередь, могло возникнуть от глагола «сигнуть» (прыгнуть, скакнуть) в южнорусских и украинских говорах. «Сигна» — человек, который резко двигается, прыгает, или же тот, кто «сигает» через препятствия. Такие прозвища давали живчикам, непоседам или, наоборот, ловким работникам.

Вторая версия, менее вероятная, — связь с литовским или польским корнем. В польском есть слово «sygnał» (сигнал), но фамилии от него обычно выглядят как Сигналович, а не Сигниенко. Если же предположить, что основа — «Сигни-» как вариант от «Сигна», то суффикс «-ий» мог превратиться в «-иенко» из-за диалектного произношения (так называемое «иканье»). В украинских фамилиях встречаются формы вроде «Сидоренко» — «Сидиренко», так что Сигниенко могло возникнуть из Сигнаенко.

Географически фамилия тяготеет к левобережной Украине и югу России (Черниговская, Полтавская области, а также Курская и Воронежская губернии). В этих местах прозвища от глагола «сигать» были обычным делом. Никакого отношения к дворянству или известным историческим родам у Сигниенко нет — это крестьянская или казацкая фамилия, образованная от бытового прозвища. Носители могли быть вольными казаками или крепостными, но сословная принадлежность здесь не прослеживается: фамилия просто закрепилась за родом, где предка звали Сигна.

Если искать однокоренные фамилии, то это Сигаев, Сигалов, Сиганков — все они от того же корня «сиг-» (прыгать). Сигниенко стоит особняком из-за суффикса «-енко», который делает её однозначно украинской по форме, но с прозрачной славянской основой. В написании возможны варианты через «а» (Сигнаенко), но в современном виде фамилия зафиксирована именно как Сигниенко.