Фамилия Синалицкая — редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Скорее всего, она имеет топонимическую основу: образована от названия населённого пункта, вероятно, Синалица или Синалец. Такие названия встречаются в белорусском и польском пограничье, а также на западе Украины. Окончание -ая и суффикс -ицк- указывают на то, что фамилия сформировалась по польской или западнорусской модели — от названия места, где жил предок. В этом случае Синалицкая — «та, что из Синалиц».

Корень «синал-» может восходить к старому слову, связанному с синевой или синим цветом (ср. «синий»). В славянских говорах «синец» — это растение василёк или синеватый камень. Однако более вероятно, что в основе лежит гидроним — название речки или озера с чистой, «синей» водой. В таком случае первым носителем фамилии был человек, переселившийся с берегов такого водоёма.

Вторая версия, менее распространённая, связывает фамилию с личным именем. В старых польских записях встречается имя Синалий (от лат. Sina — изгиб, или от греч. synalios — «морской»), но это скорее редкая книжная форма. Женская фамилия Синалицкая в таком случае — производная от мужской Синалицкий, которую давали по отцу.

Сословно фамилия могла принадлежать как шляхте (мелкой польской или ополяченной литовской), так и крестьянам, получившим прозвище по месту выхода. Встречаемость фамилии крайне низкая, что говорит о её локальном характере: скорее всего, все носители восходят к одному родовому гнезду где-то на территории современной Беларуси или Подляшья.