Фамилия Синенчеко — один из тех редких случаев, когда написание «на слух» закрепилось в официальных документах, а исходная форма, скорее всего, была иной. На первый взгляд бросается в глаза суффикс -енк(о), типичный для украинских фамилий, который указывает на происхождение с территории современной Украины или юга России. В украинской ономастике суффикс -енко означает «маленький», «сын» или «потомок»: Синенчеко — буквально «сын Синенка» или «потомок Синенчего».

Но с основой сложнее. Если бы фамилия писалась как Синенченко, она бы легко выводилась из прозвища Синенький — человека со смуглой, синюшной кожей (от постоянной работы на холоде, болезни или просто за синеватый оттенок лица). Однако вторая «н» в середине фамилии Синенчеко выпала, что могло произойти в результате упрощения произношения при переписи населения или в канцелярии. В русских говорах, особенно южных, сочетание «нч» часто произносится как «нщ» или упрощается, но на письме могли записать то, что услышали — «Синенчеко» вместо «Синенченко».

Другая, менее вероятная версия — связь с тюркским корнем «синен» или «синэн», но для украинской фамилии это экзотично. В пользу первой гипотезы говорит и то, что в современных базах данных фамилия Синенчеко встречается крайне редко, в основном на востоке Украины и в приграничных областях России (Белгородская, Ростовская области), где часто путали или теряли буквы в фамилиях при записи.

Таким образом, предок носителя этой фамилии, вероятно, носил прозвище Синенький (или Синенко) — либо из-за внешности, либо по цвету одежды или предмета, которым он владел. А само написание Синенчеко — это живой след устной речи, застывший в паспорте.