Фамилия Синиборов — редкая и по-своему загадочная. Её основа неочевидна, и здесь возможны две основные версии, причём одна значительно правдоподобнее другой.

Начнём с суффикса. Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ов, то есть отвечает на вопрос «чей?» и указывает на принадлежность предку по имени или прозвищу Синибор. Вопрос в том, что скрывается за этим прозвищем.

Первая и самая логичная версия — географическая. «Синибор» могло быть прозвищем человека, жившего у Синего бора. Бор — это сосновый лес, а «синий» в народной речи часто означал «тёмный», «дремучий», «густой». Такой лес был заметным ориентиром, и житель рядом с ним получал прозвище Синибор (по аналогии с фамилиями Белобородов, Краснобородов, где вторая часть — «борода», но здесь именно «бор»). Это типичный случай, когда прозвище по месту жительства закрепилось за родом. В пользу этой версии говорит и то, что на севере России (Архангельская, Вологодская области) встречаются топонимы вроде Синий Бор, а фамилии на -ов, образованные от названий урочищ, там обычны.

Вторая версия — сложная основа из двух корней: «синий» и «бор» в значении «борьба» (от глагола «бороться»). Тогда Синибор — это прозвище вроде «синий борец» или «тот, кто борется с синим». Но это звучит искусственно: в русских прозвищах почти нет конструкций, где цвет соединялся бы с отвлечённым действием. Такая модель характерна скорее для южнославянских фамилий (например, болгарская фамилия Синиборски), где «сини» значит «синий», а «бор» — «борец», но в русской ономастике это нетипично и, скорее всего, является привнесённым вариантом.

Таким образом, наиболее вероятно, что предок носителя фамилии Синиборов — человек, живший у дремучего синего бора, или выходец из местности с таким названием. Фамилия редкая, и её носители, скорее всего, имеют севернорусские или уральские корни, где лесные урочища давали устойчивые прозвища.