Фамилия Сипилкина — женская форма, а мужская — Сипилкин. Она образована по самой частотной русской модели: к основе прозвища или имени добавили притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей?» — «Сипилкин», то есть сын, потомок Сипилки). Сама основа у этой фамилии неочевидная, и тут открывается простор для версий.

Первое, что приходит на ум, — связь с глаголом «сипеть» или прилагательным «сиплый». В старину так могли прозвать человека с хриплым голосом, либо того, кто говорил еле слышно, сипел. Прозвища по физическим особенностям — один из древнейших пластов русских фамилий. Однако суффикс -лк- в слове «сипилка» заставляет присмотреться внимательнее. В русских говорах «сипилка» (или «сипелка») — это не просто «тот, кто сипит», а конкретный предмет: так называли дудку, свистульку, простой духовой инструмент. В словаре Даля «сипелка» — это «дудочка, сопелка, свирель». Если прозвище Сипилка дали человеку, который играл на такой дудке или делал их, то фамилия выводится напрямую от названия ремесла или музыкального инструмента. Это версия более конкретная и потому правдоподобная: прозвища по роду занятий давали часто, а музыкальный инструмент — вещь заметная.

Есть и третий, более редкий вариант: в некоторых говорах «сипеть» могло означать «шипеть, злиться, ворчать». Тогда Сипилкой называли брюзгу или сердитого человека. Но эта версия слабее, потому что для передачи такой характеристики в языке существовали более распространённые прозвища (Ворчун, Брюзга).

Таким образом, с высокой вероятностью фамилия Сипилкин (и Сипилкина) восходит к прозвищу-инструменту: предок мог быть музыкантом-дудочником или мастером по изготовлению свистулек. Встречается фамилия преимущественно в центральной России и Поволжье, но массового распространения не имеет — это достаточно редкая фамилия, что подтверждает её происхождение от узкого локального прозвища, а не от массового имени.