Фамилия Сисакьян — яркий пример армянской модели фамилии, образованной с помощью патронимического суффикса -ян (в старой орфографии — -ьянц). Этот суффикс в армянском языке выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин: он означает «принадлежащий к роду такого-то», «потомок». В основе лежит личное имя или прозвище Сисак.

Само имя Сисак имеет древние корни. В армянской традиции оно восходит к имени одного из легендарных родоначальников — Сисака, который считался эпонимом области Сюник (исторической провинции на юго-востоке современной Армении). По преданию, Сисак был внуком легендарного прародителя армян Айка. Таким образом, фамилия Сисакьян может указывать на происхождение из рода, возводившего себя к этому древнему персонажу, или на связь с местностью, названной его именем.

Впрочем, есть и более прозаичная версия. В армянском языке слово «сисак» могло использоваться как прозвище — возможно, связанное с внешностью или характером. Однако в ономастике принято считать, что для фамилий на -ян первичным источником чаще всего служит крестильное или родовое имя, а не нарицательное слово. Поэтому версия с именем Сисак (каким бы редким оно ни было сегодня) выглядит правдоподобнее.

Фамилия Сисакьян — не самая распространённая, но она встречается как в Армении, так и в армянских диаспорах России, Грузии, Ирана и стран Запада. В русскоязычной среде она сохранила исходное написание, хотя в советских документах иногда встречается вариант с одним «с» (Сиакян) — из-за упрощения при транслитерации. По сословной принадлежности предки Сисакьян могли быть как крестьянами, так и ремесленниками или священниками — армянский суффикс -ян не указывает на социальный статус, в отличие от русских фамилий дворян на -ский.